Generating wrfchemi_d01

Any issues with running WRF Chemistry

Generating wrfchemi_d01

Postby chojh88 » Sat Feb 23, 2019 4:08 am

Dear Sir,

Hello,

I would like to ask about generating wrfchemi_d01.

I carried on the tutorial exercises focus on the set-up and running of the WRF-Chem model over the Hindu Kush-Himalayan (HKH) region in WRF-Chem version 3.6.0.

It is referred to in "Exercises for Nepal Tutorial using WRF-CHEM Version 3.6(https://ruc.noaa.gov/wrf/wrf-chem/nepal ... rcises.htm)"

The whole process was carried out as it is.

However, as the "wrfout_d01_2010-07-14_00:00:00" file was created, I saw the following error message:

Code: Select all
===================================================================================
=   BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES
=   PID 32667 RUNNING AT localhost.localdomain
=   EXIT CODE: 6
=   CLEANING UP REMAINING PROCESSES
=   YOU CAN IGNORE THE BELOW CLEANUP MESSAGES
===================================================================================
YOUR APPLICATION TERMINATED WITH THE EXIT STRING: Aborted (signal 6)
This typically refers to a problem with your application.
Please see the FAQ page for debugging suggestions



What do these messages mean?

Is the "wrfout_d01_2010-07-14_00:00:00" file not created properly?

I am curious about the solution to this problem.

In addition, 'rsl.error.0000' file and namelists is added.

'rsl.error.0000' file
Code: Select all
taskid: 0 hostname: localhost.localdomain
  Ntasks in X            1 , ntasks in Y            1
 --- WARNING: traj_opt is zero, but num_traj is not zero; setting num_traj to zero.
 --- NOTE: sst_update is 0, setting io_form_auxinput4 = 0 and auxinput4_interval = 0 for all domains
 --- NOTE: grid_fdda is 0 for domain      1, setting gfdda interval and ending time to 0 for that domain.
 --- NOTE: obs_nudge_opt is 0 for domain      1, setting obs nudging interval and ending time to 0 for that domain.
 bl_pbl_physics /= 4, implies mfshconv must be 0, resetting
 --- WARNING: Turning on cu_rad_feedback also requires setting cu_diag== 1
 --- NOTE: num_soil_layers has been set to      4
 WRF V3.6 MODEL
  *************************************
  Parent domain
  ids,ide,jds,jde            1          41           1          41
  ims,ime,jms,jme           -4          46          -4          46
  ips,ipe,jps,jpe            1          41           1          41
  *************************************
 DYNAMICS OPTION: Eulerian Mass Coordinate
    alloc_space_field: domain            1 ,             330119144  bytes allocated
   med_initialdata_input: calling input_input
Timing for processing wrfinput file (stream 0) for domain        1:    0.03748 elapsed seconds
 INPUT LandUse = "USGS"
 INITIALIZE THREE Noah LSM RELATED TABLES
  LANDUSE TYPE = USGS FOUND          27  CATEGORIES
  INPUT SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS
  SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS FOUND          19  CATEGORIES
 *********************************************************************
 *             PROGRAM:WRF/CHEM V3.6 MODEL
 *                                                                   *
 *    PLEASE REPORT ANY BUGS TO WRF/CHEM HELP at                     *
 *                                                                   *
 *              wrfchemhelp.gsd@noaa.gov                             *
 *                                                                   *
 *********************************************************************
 WARNING: dust option 1 currently works only with the GOCART aerosol option.
 WARNING: sea salt option 1 currently works only with the GOCART aerosol option.
   call madronich phot initialization
Timing for Writing wrfout_d01_2010-07-14_00:00:00 for domain        1:    0.29385 elapsed seconds
  mediation_integrate: med_read_wrf_chem_emissions: Open file wrfchemi_00z_d01
  HOURLY EMISSIONS UPDATE TIME        0.0       0.0
 mediation_integrate: med_read_wrf_chem_emissions: Read emissions for time 2010-07-14_00:00:00
 **WARNING** Time in input file not being checked **WARNING**
 **WARNING** Time in input file not being checked **WARNING**
 **WARNING** Time in input file not being checked **WARNING**
 d01 2010-07-14_00:00:00 Input data processed for aux input   8 for domain   1
 open_aux_u : error opening wrfchemv_d01 for reading. 100
Timing for processing lateral boundary for domain        1:    0.04197 elapsed seconds
  Tile Strategy is not specified. Assuming 1D-Y
 WRF TILE   1 IS      1 IE     41 JS      1 JE     41
 WRF NUMBER OF TILES =   1
           1           3
*** Error in `./wrf.exe': free(): invalid next size (fast): 0x000000000d24d660 ***
======= Backtrace: =========
/lib64/libc.so.6(+0x81489)[0x7fc5905c9489]
./wrf.exe[0x18d1965]
./wrf.exe[0x18a01c6]
./wrf.exe[0x17bf66a]
./wrf.exe[0x475aa0]
./wrf.exe[0x405134]
./wrf.exe[0x404b7d]
/lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf5)[0x7fc59056a3d5]
./wrf.exe[0x404bb4]
======= Memory map: ========
00400000-03779000 r-xp 00000000 fd:00 405446745                          /root/Build_WRF/WRFV3/main/wrf.exe
03978000-03979000 r--p 03378000 fd:00 405446745                          /root/Build_WRF/WRFV3/main/wrf.exe
03979000-03a0e000 rw-p 03379000 fd:00 405446745                          /root/Build_WRF/WRFV3/main/wrf.exe
03a0e000-093e1000 rw-p 00000000 00:00 0
0b1c9000-0d26e000 rw-p 00000000 00:00 0                                  [heap]
7fc578000000-7fc578021000 rw-p 00000000 00:00 0
7fc578021000-7fc57c000000 ---p 00000000 00:00 0
7fc57c55d000-7fc58fb10000 rw-p 00000000 00:00 0
7fc58fb10000-7fc58fb1c000 r-xp 00000000 fd:00 134359814                  /usr/lib64/libnss_files-2.17.so
7fc58fb1c000-7fc58fd1b000 ---p 0000c000 fd:00 134359814                  /usr/lib64/libnss_files-2.17.so
7fc58fd1b000-7fc58fd1c000 r--p 0000b000 fd:00 134359814                  /usr/lib64/libnss_files-2.17.so
7fc58fd1c000-7fc58fd1d000 rw-p 0000c000 fd:00 134359814                  /usr/lib64/libnss_files-2.17.so
7fc58fd1d000-7fc590124000 rw-p 00000000 00:00 0
7fc590124000-7fc59013b000 r-xp 00000000 fd:00 134359824                  /usr/lib64/libpthread-2.17.so
7fc59013b000-7fc59033a000 ---p 00017000 fd:00 134359824                  /usr/lib64/libpthread-2.17.so
7fc59033a000-7fc59033b000 r--p 00016000 fd:00 134359824                  /usr/lib64/libpthread-2.17.so
7fc59033b000-7fc59033c000 rw-p 00017000 fd:00 134359824                  /usr/lib64/libpthread-2.17.so
7fc59033c000-7fc590340000 rw-p 00000000 00:00 0
7fc590340000-7fc590347000 r-xp 00000000 fd:00 134359829                  /usr/lib64/librt-2.17.so
7fc590347000-7fc590546000 ---p 00007000 fd:00 134359829                  /usr/lib64/librt-2.17.so
7fc590546000-7fc590547000 r--p 00006000 fd:00 134359829                  /usr/lib64/librt-2.17.so
7fc590547000-7fc590548000 rw-p 00007000 fd:00 134359829                  /usr/lib64/librt-2.17.so
7fc590548000-7fc59070a000 r-xp 00000000 fd:00 134359451                  /usr/lib64/libc-2.17.so
7fc59070a000-7fc59090a000 ---p 001c2000 fd:00 134359451                  /usr/lib64/libc-2.17.so
7fc59090a000-7fc59090e000 r--p 001c2000 fd:00 134359451                  /usr/lib64/libc-2.17.so
7fc59090e000-7fc590910000 rw-p 001c6000 fd:00 134359451                  /usr/lib64/libc-2.17.so
7fc590910000-7fc590915000 rw-p 00000000 00:00 0
7fc590915000-7fc590950000 r-xp 00000000 fd:00 134419867                  /usr/lib64/libquadmath.so.0.0.0
7fc590950000-7fc590b4f000 ---p 0003b000 fd:00 134419867                  /usr/lib64/libquadmath.so.0.0.0
7fc590b4f000-7fc590b50000 r--p 0003a000 fd:00 134419867                  /usr/lib64/libquadmath.so.0.0.0
7fc590b50000-7fc590b51000 rw-p 0003b000 fd:00 134419867                  /usr/lib64/libquadmath.so.0.0.0
7fc590b51000-7fc590b66000 r-xp 00000000 fd:00 134217805                  /usr/lib64/libgcc_s-4.8.5-20150702.so.1
7fc590b66000-7fc590d65000 ---p 00015000 fd:00 134217805                  /usr/lib64/libgcc_s-4.8.5-20150702.so.1
7fc590d65000-7fc590d66000 r--p 00014000 fd:00 134217805                  /usr/lib64/libgcc_s-4.8.5-20150702.so.1
7fc590d66000-7fc590d67000 rw-p 00015000 fd:00 134217805                  /usr/lib64/libgcc_s-4.8.5-20150702.so.1
7fc590d67000-7fc590e68000 r-xp 00000000 fd:00 134359459                  /usr/lib64/libm-2.17.so
7fc590e68000-7fc591067000 ---p 00101000 fd:00 134359459                  /usr/lib64/libm-2.17.so
7fc591067000-7fc591068000 r--p 00100000 fd:00 134359459                  /usr/lib64/libm-2.17.so
7fc591068000-7fc591069000 rw-p 00101000 fd:00 134359459                  /usr/lib64/libm-2.17.so
7fc591069000-7fc591188000 r-xp 00000000 fd:00 134679427                  /usr/lib64/libgfortran.so.3.0.0
7fc591188000-7fc591388000 ---p 0011f000 fd:00 134679427                  /usr/lib64/libgfortran.so.3.0.0
7fc591388000-7fc591389000 r--p 0011f000 fd:00 134679427                  /usr/lib64/libgfortran.so.3.0.0
7fc591389000-7fc59138b000 rw-p 00120000 fd:00 134679427                  /usr/lib64/libgfortran.so.3.0.0
7fc59138b000-7fc5915bd000 r-xp 00000000 fd:00 403205091                  /root/Build_WRF/LIBRARIES/mpich/lib/libmpi.so.12.1.0
7fc5915bd000-7fc5917bc000 ---p 00232000 fd:00 403205091                  /root/Build_WRF/LIBRARIES/mpich/lib/libmpi.so.12.1.0
7fc5917bc000-7fc5917ca000 r--p 00231000 fd:00 403205091                  /root/Build_WRF/LIBRARIES/mpich/lib/libmpi.so.12.1.0
7fc5917ca000-7fc5917ce000 rw-p 0023f000 fd:00 403205091                  /root/Build_WRF/LIBRARIES/mpich/lib/libmpi.so.12.1.0
7fc5917ce000-7fc591808000 rw-p 00000000 00:00 0
7fc591808000-7fc59183e000 r-xp 00000000 fd:00 403205095                  /root/Build_WRF/LIBRARIES/mpich/lib/libmpifort.so.12.1.0
7fc59183e000-7fc591a3d000 ---p 00036000 fd:00 403205095                  /root/Build_WRF/LIBRARIES/mpich/lib/libmpifort.so.12.1.0
7fc591a3d000-7fc591a3e000 r--p 00035000 fd:00 403205095                  /root/Build_WRF/LIBRARIES/mpich/lib/libmpifort.so.12.1.0
7fc591a3e000-7fc591a3f000 rw-p 00036000 fd:00 403205095                  /root/Build_WRF/LIBRARIES/mpich/lib/libmpifort.so.12.1.0
7fc591a3f000-7fc591a61000 r-xp 00000000 fd:00 134289899                  /usr/lib64/ld-2.17.so
7fc591a81000-7fc591c47000 rw-p 00000000 00:00 0
7fc591c5d000-7fc591c60000 rw-p 00000000 00:00 0
7fc591c60000-7fc591c61000 r--p 00021000 fd:00 134289899                  /usr/lib64/ld-2.17.so
7fc591c61000-7fc591c62000 rw-p 00022000 fd:00 134289899                  /usr/lib64/ld-2.17.so
7fc591c62000-7fc591c63000 rw-p 00000000 00:00 0
7ffdb4855000-7ffdb4880000 rw-p 00000000 00:00 0                          [stack]
7ffdb48f3000-7ffdb48f5000 r-xp 00000000 00:00 0                          [vdso]
ffffffffff600000-ffffffffff601000 r-xp 00000000 00:00 0                  [vsyscall]

Program received signal SIGABRT: Process abort signal.

Backtrace for this error:
#0  0x7FC591082697
#1  0x7FC591082CDE
#2  0x7FC59057E27F
#3  0x7FC59057E207
#4  0x7FC59057F8F7
#5  0x7FC5905C0D26
#6  0x7FC5905C9488
#7  0x18D1964 in __module_emissions_driver_MOD_emissions_driver
#8  0x18A01C5 in chem_driver_
#9  0x17BF669 in solve_interface_
#10  0x475A9F in __module_integrate_MOD_integrate
#11  0x405133 in __module_wrf_top_MOD_wrf_run


namelist.wps
Code: Select all
&share
 wrf_core = 'ARW',
 max_dom = 1,
 start_date = '2010-07-14_00:00:00','2010-07-14_00:00:00',
 end_date = '2010-07-19_00:00:00','2010-07-19_00:00:00',
 interval_seconds = 21600,
 io_form_geogrid = 2,
/

&geogrid
 parent_id         =   1,     1,     1,
 parent_grid_ratio =   1,     5,     5,
 i_parent_start    =   1,     6,     105,
 j_parent_start    =   1,     65,    25,
 e_we              =    41,   201,   226,
 e_sn              =    41,   311,   231,
 geog_data_res     =   '10m', '2m', '30s'
 dx        = 100000,
 dy        = 100000,
 map_proj  =  'mercator',
 ref_lat   =  25.0,
 ref_lon   =  90.0,
 truelat1  =  25.0,
 truelat2  =  25.1,
 stand_lon =  90.0,
 geog_data_path = '/root/Build_WRF/geog'
/
 ref_x     =  20.5
 ref_y     =  20.5

&ungrib
 out_format = 'WPS',
 prefix = 'FILE',
/

&metgrid
 fg_name = 'FILE'
 io_form_metgrid = 2,
/
 opt_ignore_dom_center = .true.,

&mod_levs
 press_pa = 201300 , 200100 , 100000 ,
             95000 ,  90000 ,
             85000 ,  80000 ,
             75000 ,  70000 ,
             65000 ,  60000 ,
             55000 ,  50000 ,
             45000 ,  40000 ,
             35000 ,  30000 ,
             25000 ,  20000 ,
             15000 ,  10000 ,
              5000 ,   1000
/


prep_chem_sources.inp
Code: Select all
 $RP_INPUT
!#################################################################
!  CCATT-BRAMS/MCGA-CPTEC/WRF-Chem/FIM-Chem emission models CPTEC/INPE
!  version 1.3: May 2012
!  contact: gmai@cptec.inpe.br   - http://meioambiente.cptec.inpe.br
!#################################################################


!---------------- grid_type of the grid output
   grid_type= 'mercator',
                        !'rams' = rams grid
                        ! 'polar'  = polar sterog. grid output
                        ! 'gg'  = gaussian grid output
                        ! 'll'  = lat/lon grid output
                        ! 'lambert'  = lambert grid output
                        ! 'mercator' = mercator grid output

!---------------- if the output data is for use in CATT-BRAMS model, provide at least one analysis file
!---------------- of this model (only for grid_type= 'rams')
    rams_anal_prefix = '../ANL/OPQUE',
!---------------- date of emission
    ihour=00,
    iday=14,
    imon=07,
    iyear=2010,

 !---------------- select the sources datasets to be used
   use_retro=1,  ! 1 = yes, 0 = not
   retro_data_dir='/root/Build_WRF/PREP-CHEM-SRC-1.5/datain/Emission_data/RETRO/anthro',

   use_edgar =2,  ! 0 - not, 1 - Version 3, 2 - Version 4 for some species
   edgar_data_dir='/root/Build_WRF/PREP-CHEM-SRC-1.5/datain/Emission_data/EDGARV4',

   use_gocart=1,
   gocart_data_dir='/root/Build_WRF/PREP-CHEM-SRC-1.5/datain/Emission_data/GOCART/emissions',

   use_streets =0,
   streets_data_dir='./model_datain/EMISSION_DATA/STREETS',

   use_seac4rs =1,
   seac4rs_data_dir='/root/Build_WRF/PREP-CHEM-SRC-1.5/datain/Emission_data/SEAC4RS',

   use_fwbawb =0,
   fwbawb_data_dir ='./model_datain/EMISSION_DATA/Emissions_Yevich_Logan',

   use_bioge =0, ! 1 - geia, 2 - megan
   ! ######
   ! # BIOGENIC = 1
   !bioge_data_dir ='/root/Build_WRF/PREP-CHEM-SRC-1.5/datain/Emission_data/biogenic_emissions',
   ! # MEGAN = 2
   ! ######
   bioge_data_dir='/root/Build_WRF/PREP-CHEM-SRC-1.5/datain/Emission_data/MEGAN/2000',
   ! ######

   use_gfedv2=0,
   gfedv2_data_dir='./model_datain/EMISSION_DATA/GFEDv2-8days',

   use_bbem=1,
   use_bbem_plumerise=1,

!--------------------------------------------------------------------------------------------------

!---------------- if  the merging of gfedv2 with bbem is desired (=1, yes, 0 = no)
   merge_GFEDv2_bbem =0,
!---------------- Fire product for BBBEM/BBBEM-plumerise emission models
   bbem_wfabba_data_dir  ='NONE',
   bbem_modis_data_dir    ='/home/instructor1/DATA/Global_emissions_v3/FIRE_DATA/MODIS/Fires.',
   bbem_inpe_data_dir     ='NONE',
   bbem_extra_data_dir    ='NONE',

!---------------- veg type data set (dir + prefix)
   veg_type_data_dir      ='/root/Build_WRF/PREP-CHEM-SRC-1.5/datain/surface_data/GL_IGBP_MODIS_INPE/MODIS',


!---------------- vcf type data set (dir + prefix)
  use_vcf = 0,
  vcf_type_data_dir      ='./model_datain/SURFACE_DATA/VCF/data_out/2005/VCF',
!---------------- olson data set (dir + prefix)
  olson_data_dir      ='/root/Build_WRF/PREP-CHEM-SRC-1.5/datain/Emission_data/OLSON2/OLSON',



!---------------- carbon density data set (dir + prefix)

   carbon_density_data_dir='/root/Build_WRF/PREP-CHEM-SRC-1.5/datain/surface_data/GL_OGE_INPE/OGE',

   fuel_data_dir      ='       ',


!---------------- gocart background
   use_gocart_bg=1,
   gocart_bg_data_dir='/root/Build_WRF/PREP-CHEM-SRC-1.5/datain/Emission_data/GOCART',

!---------------- volcanoes emissions
   use_volcanoes =0,
   volcano_index =0, !REDOUBT

   use_these_values='NONE',
! define a text file for using external values for INJ_HEIGHT, DURATION,
! MASS ASH (units are meters - seconds - kilograms) and the format for
! a file 'values.txt' is like this:
! 11000. 10800. 1.5e10
! use_these_values='values.txt',
   begin_eruption='198912141930',  !begin time UTC of eruption YYYYMMDDhhmm

!---------------- degassing volcanoes emissions
   use_degass_volcanoes =0,
   degass_volc_data_dir ='./model_datain/EMISSION_DATA/VOLC_SO2',

!---------------- user specific  emissions directory
!---------------- Update for South America megacities
!---------------- set 'NONE' if you do not want to use
   user_data_dir='NONE',


!--------------------------------------------------------------------------------------------------
   pond=1,   ! mad/mfa  0 -> molar mass weighted
             !          1 -> Reactivity weighted

!---------------- for grid type 'll' or 'gg' only
   grid_resolucao_lon=1.,
   grid_resolucao_lat=1.,

   nlat=192,          ! if gg (only global grid)
   lon_beg   = -85., ! (-180.:+180.) long-begin of the output file
   lat_beg   = -55., ! ( -90.:+90. ) lat -begin of the output file
   delta_lon =  60., ! total long extension of the domain (360 for global)
   delta_lat =  70., ! total lat  extension of the domain (180 for global)

!---------------- For regional grids (polar or lambert)

   NGRIDS   = 1,            ! Number of grids to run

   NNXP     = 41,50,86,46,        ! Number of x gridpoints
   NNYP     = 41,50,74,46,        ! Number of y gridpoints
   NXTNEST  = 0,1,1,1,          ! Grid number which is the next coarser grid
   DELTAX   = 100000.,
   DELTAY   = 100000.,         ! X and Y grid spacing

   ! Nest ratios between this grid and the next coarser grid.
   NSTRATX  = 1,2,3,4,           ! x-direction
   NSTRATY  = 1,2,3,4           ! y-direction

   NINEST = 1,10,0,0,        ! Grid point on the next coarser
   NJNEST = 1,10,0,0,        !  nest where the lower southwest
                             !  corner of this nest will start.
                             !  If NINEST or NJNEST = 0, use CENTLAT/LON
   POLELAT  = 25.,          ! If polar, latitude/longitude of pole point
   POLELON  =  90.,         ! If lambert, lat/lon of grid origin (x=y=0.)

   STDLAT1  = 25.0,          ! If polar for BRAMS, use 90.0 in STDLAT2
   STDLAT2  = 25.1,          ! If lambert, standard latitudes of projection
                                                        !(truelat2/truelat1 from namelist.wps, STDLAT1 < STDLAT2)
                            ! If mercator STDLAT1 = 1st true latitude
   CENTLAT  = 25.,  -23., 27.5,  27.5,
   CENTLON  = 90.,  -46.,-80.5, -80.5,



!---------------- model output domain for each grid (only set up for rams)
   lati =  -90.,  -90.,   -90.,
   latf =  +90.,  +90.,   +90.,
   loni = -180., -180.,  -180.,
   lonf =  180.,  180.,   180.,

!---------------- project rams grid (polar sterogr) to lat/lon: 'YES' or 'NOT'
   proj_to_ll='YES',

!---------------- output file prefix (may include directory other than the current)
   chem_out_prefix = 'HKH_DATA',
   chem_out_format = 'vfm',
!---------------- convert to WRF/CHEM (yes,not)
  special_output_to_wrf = 'YES',

$END


namelist.input
Code: Select all
 &time_control
 run_days                            = 5,
 run_hours                           = 0,
 run_minutes                         = 0,
 run_seconds                         = 0,
 start_year                          = 2010, 2010, 2000,
 start_month                         = 07,   07,   01,
 start_day                           = 14,   14,   24,
 start_hour                          = 00,   00,   12,
 start_minute                        = 00,   00,   00,
 start_second                        = 00,   00,   00,
 end_year                            = 2010, 2010, 2000,
 end_month                           = 07,   07,   01,
 end_day                             = 19,   16,   25,
 end_hour                            = 00,   00,   12,
 end_minute                          = 00,   00,   00,
 end_second                          = 00,   00,   00,
 interval_seconds                    = 21600,
 input_from_file                     = .true.,.true.,.false.,
 history_interval                    = 60,  60,   60,
 frames_per_outfile                  = 1000, 1000, 1000,
 restart                             = .false.,
 restart_interval                    =    0,
 io_form_history                     = 2,
 io_form_restart                     = 2,
 io_form_input                       = 2,
 io_form_boundary                    = 2,
 auxinput6_inname                    = 'wrfbiochemi_d01',
 auxinput7_inname                    = 'wrffirechemi_d<domain>',
 auxinput8_inname                    = 'wrfchemi_gocart_bg_d<domain>',
 auxinput12_inname                   = 'wrf_chem_input',
 auxinput13_inname                   = 'wrfchemv_d<domain>',
 auxinput5_interval_m                = 86400, 86400, 60,
 auxinput7_interval_m                = 86400, 86400, 60,
 auxinput8_interval_m                = 86400, 86400, 60,
 auxinput13_interval_m               = 86400, 86400, 60,
 io_form_auxinput2                   = 2,
 io_form_auxinput5                   = 2,
 io_form_auxinput6                   = 0,
 io_form_auxinput7                   = 2,
 io_form_auxinput8                   = 2,
 io_form_auxinput12                  = 0,
 io_form_auxinput13                  = 0,
 debug_level                         = 0,
 auxinput1_inname                    = "met_em.d<domain>.<date>",
/

 &dfi_control
/

 &domains
 time_step                           = 600,
 time_step_fract_num                 = 0,
 time_step_fract_den                 = 1,
 max_dom                             = 1,
 s_we                                =   1,    1,     1,
 e_we                                = 41,    41,    94,
 s_sn                                =   1,    1,     1,
 e_sn                                = 41,    41,    91,
 e_vert                              = 31,    31,    28,
 num_metgrid_levels                  = 27,
 num_metgrid_soil_levels             = 4,
 dx                                  = 100000, 4000,  3333.33,
 dy                                  = 100000, 4000,  3333.33,
 grid_id                             = 1,     2,     3,
 parent_id                           = 0,     1,     2,
 i_parent_start                      = 1,     6,    30,
 j_parent_start                      = 1,     65,    30,
 parent_grid_ratio                   = 1,     5,     3,
 parent_time_step_ratio              = 1,     5,     3,
 p_top_requested                     = 5000,
 feedback                            = 1,
 smooth_option                       = 0
 p_top_requested                     = 5000
 zap_close_levels                    = 50
 interp_type                         = 1
 t_extrap_type                       = 2
 force_sfc_in_vinterp                = 0
 use_levels_below_ground             = .true.
 use_surface                         = .true.
 lagrange_order                      = 1
 /
 sfcp_to_sfcp                        = .true.

 &physics
 mp_physics                          = 4,     2,     2,
 progn                               = 0,
 ra_lw_physics                       = 1,     1,     1,
 ra_sw_physics                       = 2,     1,     1,
 radt                                = 30,    30,    30,
 sf_sfclay_physics                   = 1,     1,     1,
 sf_surface_physics                  = 2,     2,     1,
 bl_pbl_physics                      = 1,     1,     1,
 bldt                                = 0,     0,     0,
 cu_physics                          = 5,     5,     0,
 cu_diag                             = 1,     0,     0,
 cudt                                = 0,     0,     0,
 ishallow                            = 0,
 isfflx                              = 1,
 ifsnow                              = 1,
 icloud                              = 1,
 surface_input_source                = 1,
 num_soil_layers                     = 4,
 sf_urban_physics                    = 0,     0,     0,
 mp_zero_out                         = 2,
 mp_zero_out_thresh                  = 1.e-12
 maxiens                             = 1,
 maxens                              = 3,
 maxens2                             = 3,
 maxens3                             = 16,
 ensdim                              = 144,
 cu_rad_feedback                     = .true.,
 /

 &fdda
 /

 &dynamics
 rk_ord                              = 3,
 w_damping                           = 1,
 diff_opt                            = 1,
 km_opt                              = 4,
 diff_6th_opt                        = 0,
 diff_6th_factor                     = 0.12,
 base_temp                           = 290.
 damp_opt                            = 0,
 zdamp                               = 5000.,  5000.,  5000.,
 dampcoef                            = 0.01,   0.01,   0.01
 khdif                               = 0,      0,      0,
 kvdif                               = 0,      0,      0,
 non_hydrostatic                     = .true., .true., .true.,
 moist_adv_opt                       = 2,      0,      0,
 scalar_adv_opt                      = 2,      0,      0,
 chem_adv_opt                        = 2,      0,      0,
 tke_adv_opt                         = 2,      0,      0,
 time_step_sound                     = 4,      4,      4,
 h_mom_adv_order                     = 5,      5,      5,
 v_mom_adv_order                     = 3,      3,      3,
 h_sca_adv_order                     = 5,      5,      5,
 v_sca_adv_order                     = 3,      3,      3,
 /

 &bdy_control
 spec_bdy_width                      = 5,
 spec_zone                           = 1,
 relax_zone                          = 4,
 specified                           = .true., .false.,.false.,
 nested                              = .false.,.false.,.false.,
 /

 &grib2
 /

 &namelist_quilt
 nio_tasks_per_group = 0,
 nio_groups = 1,
 /

 &chem
 kemit                               = 1,
 chem_opt                            = 301,
 bioemdt                             = 30,
 photdt                              = 30,
 chemdt                              = 60,
 io_style_emissions                  = 1,
 emiss_opt                           = 5,          0,
 emiss_opt_vol                       = 0,          0,
 emiss_ash_hgt                       = 20000.,
 chem_in_opt                         = 0,          0,
 phot_opt                            = 1,          0,
 gas_drydep_opt                      = 1,          1,
 aer_drydep_opt                      = 1,          1,
 bio_emiss_opt                       = 1,          0,
 ne_area                             = 1,
 depo_fact                           = 0.25,
 dust_opt                            = 1,
 dmsemis_opt                         = 1,
 seas_opt                            = 1,
 gas_bc_opt                          = 1,          0,
 gas_ic_opt                          = 1,          0,
 aer_bc_opt                          = 1,          0,
 aer_ic_opt                          = 1,          0,
 gaschem_onoff                       = 1,          0,
 aerchem_onoff                       = 1,          0,
 wetscav_onoff                       = 0,          0,
 cldchem_onoff                       = 0,          0,
 vertmix_onoff                       = 1,          0,
 chem_conv_tr                        = 1,          0,
 conv_tr_wetscav                     = 0,          0,
 conv_tr_aqchem                      = 0,          0,
 biomass_burn_opt                    = 1,          0,
 plumerisefire_frq                   = 30,         0,
 have_bcs_chem                       = .false., .false., .false.,
 aer_ra_feedback                     = 1,
 aer_op_opt                          = 0,
 opt_pars_out                        = 0,
 diagnostic_chem                     = 0,
 /


Thank you for your reply.
chojh88
 
Posts: 1
Joined: Sat Feb 23, 2019 3:46 am

Re: Generating wrfchemi_d01

Postby luohao » Wed Jun 05, 2019 5:50 am

I have the same error, how did you solve it?
luohao
 
Posts: 2
Joined: Sun Jun 02, 2019 9:37 pm


Return to Runtime Problems

Who is online

Users browsing this forum: No registered users and 2 guests

cron